Proponowane miejsce wiązania heparyny w antytrombinie na bazie argininy 47. Nowy wariant Rouen-II, 47 Arg do Ser.

Antytrombina Rouen-II, nowy dziedziczny wariant antytrombiny-III, znaleziono u dwóch członków rodziny bez określonej historii zakrzepicy. Badani mieli normalne antygenowe stężenia antytrombiny i normalną progresywną aktywność hamującą. Jednak wariant miał wadliwe aktywności kofaktora heparyny i siarczanu heparanu i nie był aktywowany przez syntetyczny pentasacharyd reprezentujący minimalną sekwencję heparyny. Nieprawidłową antytrombinę wyizolowano stosując chromatografię z heparyną-sefarozą i po elektroforezie przy pH 8,6 migrowano bardziej anodowo niż normalnie. Przeprowadzono dwuwymiarowe mapowanie peptydów trawienia proteaz V8 tryptem i Staphylococcus aureus, a nienormalny peptyd umiejscowiono metodą barwienia tryptofanem. Badania sekwencji aminokwasowych wykazały substytucję argininy w reszcie 47 przez serynę. Dowody silnie sugerują, że arginina 47 jest głównym miejscem wiązania heparyny w antytrombinie i że stanowi część proponowanego dodatnio naładowanego miejsca liniowego (do którego wiąże się heparyna), które rozciąga się na powierzchni cząsteczki od helisy A do D.

Czytaj więcej artykułów medycznych...